Сотрудниками кафедры ведется разнонаправленная научно-исследовательская работа.
Основными направлениями научных исследований кафедры является изучение инфекционной патологии у детей в современных условиях: нейроинфекций, воздушно-капельных и респираторных инфекций, острых кишечных инфекций, герпетических и ТORCH- инфекций.
В последнее время кафедра уделяет большое значение клинико-патогенетическим особенностям, ранней диагностики и усовершенствованию принципов лечения вирусных гепатитов у детей нашей республики.